I Møllehuset er der ansat lærere og pædagogisk personale, som alle gennemgår en løbende miljøterapeutisk uddannelse. 

Alle Møllehusets medarbejdere får løbende supervision. Derudover er der tilknyttet en behandlingspsykolog hvis primære opgave er at guide og vejlede miljøterapeuterne bl.a. via behandlingskonferencer.

Alle Møllehusets medarbejdere er gennemgående i elevernes hverdag på skolen.